| Ordernr. | 865 |
| Analysenaam | JAK2 V617F ddPCR - EDTA volbloed/beenmerg - 160µl volbloed/beenmerg (9µl aan 5ng/µl DNA extract) |
| Aanvraagformulier | Aanvraag Moleculair Pathologisch Onderzoek |
| Synoniemen | digital PCR, digital droplet PCR, JAK2, Janus kinase. Deze analyse betreft énkel JAK2 V617F (exon 14) analyse. Indien een uitgebreide analyse dient te worden uitgevoerd (eg. ook exon 12), dient de code 856 te worden aangevraagd (NGS). |
| Eenheid | % (fractional abundance) |
| Opmerking extern | Er wordt gebruik gemaakt van het QX200 platform (Bio-Rad) in combinatie met mutatie assays eveneens getest en gecommercialiseerd door Bio-Rad. De mutatie assays maken voornamelijk gebruik van de FAM/HEX combinatie. FAM (blauw) kanaal voor mutatiedetectie en HEX (groen) kanaal voor wildtype detectie. Er dient een vooraf bepaalde hoeveelheid DNA te worden toegevoegd aan de Supermix (Biorad) waarna in de DG8 cartridges olie en staal/mix toegevoegd worden. In de droplet generator (Bio-Rad) worden vervolgens de druppels gevormd. Na PCR amplificatie wordt de plaat met de druppels uitgelezen in de droplet reader. Data analyse gebeurt met behulp van de Quantasoft software.
Rapportering op basis van klinische grenswaarde:
- groter dan 5% FA: klinisch aanwezig
- tussen 0.5% en 5%: klinisch grijze zone
- kleiner dan 0.5%: klinisch afwezig
Daarnaast werden de analytische metrieken voor deze assay eveneens bepaald:
- Limit of blank: 0.01%
- Limit of detection: 0.04%
- Limit of quantification: 0.16%
|
| Klinische informatie | Het JAK2 (Janus kinase 2) gen codeert voor een tyrosine kinase, het JAK2 proteïne, betrokken in de signaaltransductie voor de proliferatie van de myeloïde voorlopercel. In de literatuur wordt de centrale rol van de JAK2 V617F puntmutatie (2343G>T) in de pathogenese van de chronische myeloproliferatieve aandoeningen aangetoond. De JAK2 V617F mutatie komt hoofdzakelijk voor bij patiënten met BCR-ABL negatieve chronische myeloproliferatieve aandoeningen, voornamelijk polycythemia vera (65%-97%), essentiële trombocytose (25%-55%) en chronische idiopatische myelofibrose (35%-57%). Doch de afwezigheid van JAK2 V617F/G1849T sluit niet uit dat er andere, minder frequente, (exon 12) JAK2 mutaties -relevant voor MPN diagnostiek- aanwezig kunnen zijn. Ook MPN-gerelateerde mutaties in bvb MPL en CalR kunnen mogelijk zijn. Hiervoor verwijzen we naar NGS Myeloid. |
| Externe links | |
| Recipiënt 1e keuze | EDTA volbloed/beenmerg |
| Recipiënt alternatief | |
| Minimale hoeveelheid | 160µl volbloed/beenmerg (9µl aan 5ng/µl DNA extract) |
| Afnamecondities | standaard afname |
| Transportcondities | bewaring in koelkast. |
| Stabiliteit 4°C | 1 week |
| Dringend | Nee |
| Uitvoerfrequentie | 1x/2weken |
| Antwoordtijd | 14 dagen |
| Accreditatie (BELAC 377-MED) | Ja |
| Aanrekening | |
| Doorstuuranalyse | Nee |
| Categorie | Moleculaire biologie hemato-oncologie |
| Referentiewaarden | |
| Referentiewaarden laatste wijziging | |
| bijlage |
